NN, det går självklart bra att byta fläkt så länge den har samma kapacitet och går på samma matningsspänning (förståss)
Det kan hända att fläkten sitter där för att kylflänsarna är i minst laget, eller för att köras igång när det blir verkligt varmt...
Körs fläkten kontinuerligt?
Det finns ju inget som hindrar att man kopplar ur fläktarna...
Men då lär man hålla koll på temperaturen istället!
Om man antar att det är normala bipolära transistorer i steget så ska de ju helst aldrig komma upp i 75 grader C. Vill man vara på den säkra sidan: Montera en temperaturvakt som bryter matningen vid 60-70 grader.
Vad jag skulle gjort om jag bytt fläkt är att sätta på en så stor (stor diameter) fläkt som är praktiskt att montera. Det skadar ju aldrig att få lite överkapacitet... Samtidigt så kan du montera en pot så att du kan ställa fläkthastigheten

Eller ännu bättre! Ett PTC motstånd i serie med fläkten (eller vilken sort det nu är som minskar resistansen med ökande temperatur) som monteras på kylflänsen nära transistorerna. Då får du ju en automagisk fläktstyrning som ökar fläktkapacitet när det behövs.
Dock så bör motståndets maximala värde vara mer än fläktens resistans, fläkten går då som lägst på halvfart.